Tras una primera tanda de entrenamientos libres totalmente nula en donde sólo Hiroshi Aoyama se animó a girar sobre el mojado asfalto, Jorge Lorenzo marcó en la segunda tanda el giro más rápido en el circuito de Estoril.
Ya con sol, el español aprovechó para mejorar los registros con cierta facilidad. Así, Lorenzo acabó protagonizando el giro más rápido de la categoría en su penúltimo giro con 1:48.52.
Al mejor tiempo de Lorenzo en esta ocasión le siguió una buena actuación del estadounidense Nicky Hayden, que fue segundo, justo por delante de Valentino Rossi, quien por momentos llegó a detentar el mejor tiempo de la cilindrada, si bien al final se tuvo que conformar con la tercera plaza.
Casey Stoner, vencedor de la última carrera disputada hasta el momento, en Australia, ocupó por algunos instantes la cabeza de la clasificación por tiempo, pero no pudo mejorar su registro y acabó relegado a la cuarta plaza a poco más de medio segundo de Lorenzo.