El último informe del Consorcio Proyecto PAIS, creado por el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación, sobre la situación epidemiológica hasta el 19 de mayo de 2021, no detectó la variante Beta (Sudáfrica) ni Delta (India) del coronavirus, pero sugiere considerar al linaje C.37 (variante Andina) como de interés regional por el incremento sostenido de su frecuencia de detección en el Amba (Ciudad de Buenos Aires y 40 municipios bonaerenses).
El reporte 23) sobre vigilancia de variantes del sars-coV-2 entre el 2 de abril y el 19 de mayo de este año abarca las jurisdicciones de Ciudad de Buenos Aires (115), provincia de Buenos Aires (133 del GBA, dos de Amba sin origen definido y 24 de las Regiones Sanitarias III y X de la PBA), Córdoba (30), Entre Ríos (25), Neuquén (36), y Santa Fe (24).
Se realizó la secuenciación parcial del gen que codifica para la proteína Spike (de la corona del virus) en 341 muestras y la secuenciación del genoma completo en 48 muestras obtenidas de individuos residentes en las jurisdicciones estudiadas.
La secuenciación estuvo a cargo del Consorcio Argentino de Genómica de sars-cov-2, a través del Laboratorio de Virología del Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez, el Laboratorio UGB-Inta de Castelar, el Laboratorio Central de la ciudad de Córdoba, su par de Neuquén, el Laboratorio del Inta y Conicet de Rafaela y su homólogo de Córdoba.
Variante del Reino Unido: cuatro en Santa Fe
Se identificó la variante Alpha (B.1.1.7, Reino Unido) en 45 casos. De estos, nueve corresponden a Caba, 16 al Gran Buenos Aires, cuatro al interior de esa provincia y dos casos de Amba. Además, nueve casos correspondieron a la provincia de Entre Ríos, un caso de la provincia de Neuquén y cuatro casos a Santa Fe.
Con la excepción del caso de Neuquén, los casos corresponden a individuos sin antecedente de viaje al exterior o contacto estrecho con viajeros.
Variante de Manaos: 14 en Santa Fe
Se identificó la variante Gamma (P.1, Manaos) en un total de 181 casos. 51 son de Caba, 52 de GBA y 12 del interior de la PBA. Otros 13, a la provincia de Entre Ríos, 24 en Neuquén, 14 en Santa Fe y 13 en Córdoba.
Todos estos casos corresponderían a infecciones de individuos sin antecedente de viaje al exterior o contacto estrecho con viajeros. En Córdoba se detectaron dos casos en individuos con antecedente de viaje a Paraguay y Brasil.
Variante andina
Se identificó la combinación de mutaciones compatibles con el linaje C.37 o “variante Andina” (S_L452Q, S_F490S y el cambio nucleotídico sinónimo c2169t) en un total de 127 casos.
50 de esos casos provienen de Caba, 56 de GBA, cuatro del interior de la PBA. Otros dos casos correspondieron a Entre Ríos, seis a Neuquén y siete a Córdoba.
Todos estos casos corresponderían a infecciones de individuos sin antecedente de viaje al exterior o contacto estrecho con viajeros, con la excepción de dos casos de Córdoba que presentaron antecedente de viaje a México y República Dominicana.
No se detectó la combinación de mutaciones característica de la variante Beta (B.1.351, Sudáfrica) ni de la Delta (B.1.617.2, India).
El informe destaca un aumento en la frecuencia de detección de las variantes Gamma (P.1, Manaos) y del linaje C.37 (Andina) y una estabilización en la frecuencia de la variante Alpha, (B.1.1.7, Reino Unido) en el Amba durante las últimas semanas epidemiológicas en casos sin nexo epidemiológico con turismo al exterior.
Frecuencias de las variantes
En las emana epidemiológica SE16-19, la variante Gamma (P.1, Manaos) alcanzó frecuencias superiores al 35% en Caba y 27% en GBA. El linaje C.37 (Andina) presentó frecuencias superiores al 42% en Caba y 32% en el GBA.
La variante Alpha (B.1.1.7, Reino Unido) disminuyó su frecuencia a menos del 10% en Caba y del 15% en GBA.
En ese período, menos del 6% (Caba) y del 5% (GBA) de los casos analizados pertenecieron a las otras variantes o presentaron mutaciones de interés.
Hasta el momento, sobre un total de 2238 muestras analizadas a través de la vigilancia activa por secuenciación de Spike o de genoma completo, las variantes más detectadas en Caba y GBA fueron el linaje C.37 (variante Andina) en 412 casos y la variante Gamma (P.1, Manaos) en 398 casos, especialmente en las últimas Semanas Epidemiológicas analizadas.
Alerta por la Andina
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El proyecto PAIS considera que el linaje C.37 (variante Andina) debería ser considerado, al menos, «Variante de interés regional» dado el incremento sostenido de su frecuencia de detección en la región del Amba en las últimas semanas epidemiológicas. Es lo mismo que se observó en otros países de la región, como Perú y Chile.
Nuevas formas de denominar las variantes de interés y de preocupación
El 31 de mayo de 2021, la Organización Mundial de la Salud anunció nuevas formas de llamar a las variantes de interés (VOI) y variantes de preocupación (VOC) para facilitar la comunicación pública sobre las variantes del Sars-cov-2.
Entre las razones, se incluyen la existencia de diferentes nomenclaturas genómicas difíciles de comunicar debido a su complejidad y la potencial estigmatización a las etiquetas asignadas a países o áreas de detección. Es por esto, que se le asignaron a los VOI y VOC nuevas etiquetas basadas en el alfabeto griego para denominarlas mundialmente.
