Las intervenciones fueron ordenadas por el Juzgado Federal de Reconquista, a solicitud del fiscal Roberto Salum, que designó al EAAF como perito en el marco de un Juicio por la Verdad que intenta reconstruir lo ocurrido en la masacre y hallar los restos de las víctimas.
El EAAF había realizado una primera prospección en terreno en 2023, con el consentimiento de las comunidades originarias locales, en el marco de la causa “Av. De la verdad histórica Masacre de San Antonio”. Con nueva información, entre 3 y el 7 de agosto de este año se llevaron a cabo tareas de excavación arqueológica y recuperación de restos óseos pertenecientes, en principio, a dos individuos. Además, se delimitó la fosa existente con vistas a una intervención más extensa.
San Antonio de Obligado albergó una reducción (asentamiento forzado) de los pueblos originarios Qom y Mocoví bajo la supervisión de la orden Franciscana. En marzo de 1887 se produjo la ejecución de integrantes de la comunidad originaria a manos del Ejército Argentino, por orden del entonces gobernador de Misiones, Rudecindo Roca.
A partir de fuentes documentales recabadas por profesionales de la Universidad Nacional de La Plata, el Colectivo GUIAS, la Universidad Nacional de Córdoba, junto a testimonios orales conservados por los descendientes de las comunidades Qom y Mocoví, se impulsó la investigación judicial orientada a reconstruir los hechos acontecidos y la reparación histórica de las comunidades afectadas.